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HorTarget®

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使用 HorTarget® 基於 PCR 的文庫製備、illumina® 邊合成邊定序 (SBS) 結合(NGS) 技術和自動化分析，研究人員可以同時分析 DNA 和 RNA。

從小於 1 ng 的高品質的 DNA 和 RNA（建議 10 ng 來自 FFPE 組織的 DNA 和 RNA）開始，該平台可以研究與多種癌症類型相關的基因，包括肺癌、結腸癌、乳腺癌、卵巢癌、黑色素瘤和前列腺癌。低輸入的樣本要求可以適用於各種樣品類型，包括福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織或是實體腫瘤組織。

HorTarget® 能夠快速準確地評估轉化和臨床腫瘤學研究的基因組變異。

項目 規格內容
檢測基因數量 52
基因變異檢測類型 單核苷酸變異(SNVs: single nucleotide variations)，小片段嵌入或刪除變異(indels: insertions/deletions)，拷貝數變異(CNVs: copy number variants)，基因融合(genefusion)
擴增子數量 DNA : 269, RNA : 284
DNA/RNA 輸入需求量 1-100 ng (建議量 10 ng/pool)
No. of pools per panel 1 pool for DNA panel,
1 pool for RNA panel,
適用檢體類型 FFPE 檢體、血液檢體
標的基因的有效覆蓋率(當定序深度達到500倍以上，且總資料輸出達到建議通量時) >95%
覆蓋一致性(標的基因區段至少達到 0.2倍平均覆蓋率) >95%
有效序列比對率(Percent On-Target Aligned Reads) >80%



HorTarget® 採用illumina®的分析套組（Targeted Resequencing Assay ），用於對 52 個已知與實體瘤相關的基因進行特異性突變位點分析。

  DNA基因列表
AKT1 ALK AR BRAF
CCND1 CDK4 CDK6 CTNNB1
DDR2 EGFR ERBB2 ERBB3
ERBB4 ESR1 FGFR1 FGFR2
FGFR3 FGFR4 GNA11 GNAQ
HRAS IDH1 IDH2 JAK1
JAK2 JAK3 KIT KRAS
MAP2K1 MAP2K2 MET MTOR
MYC MYCN NRAS PDGFRA
PIK3CA RAF1 RET ROS1
SMO

  RNA基因列表
ABL1 ALK AKT3 AXL
BRAF EGFR ERBB2 ERG
ETV1 ETV4 ETV5 FGFR1
FGFR2 FGFR3 MET NTRK1
NTRK2 NTRK3 PDGFRA PPARG
RAF1 RET ROS1



  標靶用藥相關基因(42)
ABL1 AKT1 ALK AR
BRAF CCND1 CDK4 CDK6
CTNNB1 DDR2 EGFR ERBB2
ERBB3 ERBB4 ESR1 FGFR1
FGFR2 FGFR3 FGFR4 GNAQ
HRAS IDH1 IDH2 JAK3
KIT KRAS MAP2K1 MAP2K2
MET MTOR MYC MYCN
NRAS NTRK1 NTRK2 NTRK3
PDGFRA PIK3CA RAF1 RET
ROS1 SMO
  免疫治療相關基因(4)
ALK EGFR JAK1 JAK2
  遺傳性腫瘤相關基因(4)
CDK4 CDK6 KIT PDGFRA




  • 提供FDA該適應症藥物、新增其他適應症參考藥物。
  • 明確標示抗藥性基因位點與相關藥物。
  • 專業諮詢師進行報告輔助說明。
  • 協助分析提供最新相關治療方案。
HorTarget® 與實體瘤相關的 52 個關鍵基因中的數百個突變。  該平台的基因內容是根據已發表的文獻、當前指南（國家綜合癌症網絡『NCCN』、分子病理學協會『AMP』、國病理學家學『CAP』、歐洲腫瘤內科學會『ESMO』),及相關的臨床試驗選擇的。

HorTarget® 的分析報告可以提供 DNA 樣本中的單核苷酸變異 (SNV)、插入/缺失 (indel) 和拷貝數變異 (CNV)，或 RNA 樣本中的基因融合變異。 

石蠟包埋(FFPE)切片
  • 1片H&E Stain切片
  • 10片未經處理切片 
  • 表面積25mm2，腫瘤含量 ≥30％：5 μm厚度須提供 10 片切片
  • 表面積25mm2，腫瘤含量 ≥20％：5 μm厚度須提供 15 片切片
  • 表面積25mm2，腫瘤含量 ≥10％：5 μm厚度須提供 20 片切片
新鮮腫瘤穿刺組織
  • 1片H&E Stain切片
  • 20片未經處理切片 
  • 穿刺所涵蓋的腫瘤部位比例>50%



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